学校全力推进学科建设，在浙江省属高校中首批获得国家重点学科（中医临床基础），中医学入选浙江省登峰学科建设计划，中药学、中西医结合入选省优势特色学科建设计划。2024软科世界大学学术排名1000强中列665位（全国中医药院校第二位），3个学科进入ESI全球排名前1%。